?bergangsmetalle und phototrophes Wachstum: Ein neuer Ansatz der constraintbasierten Modellierung gro?er Stoffwechselnetze

At a glance

Project duration
03/2012  – 12/2015
Funded by

Einstein Foundation Berlin Einstein Foundation BerlinEinstein Foundation BerlinEinstein Foundation BerlinEinstein Foundation Berlin

Project description

Cyanobakterien sind die einzigen bekannten Prokaryoten mit der F?higkeit zur O2-entwickelnden Photosynthese. Sie kommen unter nahezu allen Umweltbedingungen vor. Durch ihre hohe Anzahl, vor allem in den Ozeanen, tragen Cyanobakterien erheblich zu den den globalen O2- und CO2-Zyklen bei. Aufgrund ihrer phototrophen Lebensweise sind Cyanobakterien auch interessante Kandidaten zur direkten Herstellung von Biokraftstoffen aus CO2 und Sonnenlicht. Ein wichtiger Ansatz zur Erforschung des cyanobakteriellen Stoffwechsels ist die Erstellung mathematischer Modelle des enzymatischen Reaktionsnetzwerks. Ein solches Modell erlaubt die mathematische Analyse und Vorhersage komplexer Stoffwechselvorg?nge mit weitreichenden Anwendungen in der Biotechnologie. Allerdings sind gegenw?rtige Stoffwechselmodelle auf sogenannte Makron?hrstoffe, wie Kohlenstoff und Stickstoff, beschr?nkt. Mikron?hrstoffe, vor allem ?bergangsmetalle, werden ignoriert. Gleichwohl sind Mikron?hrstoffe essentiell für alle photosynthetischen Prozesse und unter vielen Lebensbedingungen limitierend für das Wachstum der Cyanobakterien und anderer photosynthetischer Lebewesen. Das Ziel des beantragten Projekts ist deshalb, ?bergangsmetalle explizit in die st?chiometrische und constraintbasierte Beschreibung metabolischer Netze einzubeziehen. Dazu sollen bestehende Erfahrungen mit zeitaufgel?sten Hochdurchsatzverfahren und mathematischer Modellierung genutzt und miteinander verknüpft werden.

Project head

  • Person

    Prof. i. R. Dr. Wolfgang Lockau

    • Plant Biochemistry

Cooperation partners

  • Cooperation partner
    UniversityGermany

    Free University of Berlin

  • Cooperation partner
    UniversityIsrael

    Hebrew University of Jerusalem